Научная деятельность ХГЭУ должна способствовать формированию качественно нового типа высшего учебного заведения, основанного на органическом сочетании духовно-светского образования с научно-исследовательской деятельностью, что обусловлено необходимостью духовно-инновационного обновления общества, а, следовательно, и системы научных знаний.
Принцип целостности и гармонизации трех составляющих в подготовке духовно-интеллектуального капитала, а именно «образования – исследований – инноваций», является доминирующим в ХГЭУ и полностью соответствует развитию системы высшего образования в странах Евросоюза.
Научно-исследовательская работа в ХГЭУ, представляет из себя, работу научного характера, включающую:
- научный поиск решения актуальных социальных проблем,
- работу с грантовыми проектами,
- обеспечения функционирования науки;
- подготовка и стажировка научных кадров,
- проведение совместных международных конференций,
- семинаров и деловых встреч и пр. на основах христианского мировоззрения.